广东省农垦中心医院始建于1953年,1993年经广东农垦总局批准正式命名为广东省农垦中心医院。1995年被评为“爱婴医院”,1996年被评为国家三级甲等医院。2003年通过广东省高等医学院校教学医院评审,现为广东医学院、南方医科大学及广西医科大学等院校的教学医院。