怀化疾控中心是全市疾病预防控制、卫生监测检验与评价、健康教育与促进、科研培训与指导、技术咨询与服务的业务技术指导中心。
怀化市第二人民医院始建于1944年，前身为湖南省洪江医院，现已发展成为拥有怀化总院、洪江医院、靖州医院的现代化医院集团。经省卫生厅、市卫生局批准，于2010年6月12日加挂怀化市肿瘤医院名牌，并成为湖南省肿瘤医院技术指导医院。
怀化市中医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健、急救为一体的国家二级甲等综合性中医院，并为怀化医学高等专科学校临床教学医院、湖南省中医药大学附一院临床指导医院、天津中医药大学附一院“石氏中风单元”疗法定点协作医院，也是全市医疗、生育保险、工伤、司法鉴定、劳动伤残鉴定定点医院，多家财产保险、人寿保险和交通事故救治定点医院。怀化市中医院以多种形式服务于社会，辐射湘、桂、黔、鄂、渝等五省周边五十多个县（市、区）。
怀化市第三人民医院是中南大学湘雅医学院、南华大学医学院教学、实习医院；是怀化市120紧急救援中心网络医院、怀化显微创伤外科中心、怀化市心血管病防治研究中心、湖南省个体化给药咨询指导怀化分中心；拥有显微外科、神经外科、腔镜外科、呼吸内科、高血压病科等重点学科。医院先后被授予全国卫生系统先进集体、全国模范职工之家、全国绿化模范单位、省文明建设先进单位等荣誉称号。
前身为“湖南省铁指医院”的怀化市第一人民医院是湖南西部最大的集医疗、科研、教学、康复、预防于一体的三级甲等综合型医院，系南华大学临床学院、附属医院和硕士学位培养点，为全国百佳医院、全国百姓放心示范医院。
怀化学院创办于1958年，前身是怀化师范高等专科学校，2002年经国家教育部批准升格为全日制普通本科院校。
