新疆维吾尔自治区教育厅作为自治区人民政府组成部门,主管全区教育工作。新中国成立后的1950年,新疆省成立教育厅;1970年9月改教育厅为教育局;1982年改教育局为教育厅;1986年改教育厅为教育委员会,2000年8月改教育委员会为教育厅。