西藏藏医学院前身系西藏藏医学校(中专)和西藏大学藏医系,1989年9月成立西藏大学藏医学院,1993年2月经国家教委批准独立设置为西藏藏医学院。从此,藏医药高等教育正式列入全国普通高等教育的序列,是国内外第一所独立设置的培养高层次藏医药专业人才的高等学府。